RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068056.11

Ddx39b-201, Transcript of Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ddx39b, Length 1,739 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa27.71■■■□□ 2.03
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nsd2Q8BVE8 1365 aa27.18■■□□□ 1.94
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Skint5A7XUY5 1461 aa27.12■■□□□ 1.93
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 P3h3Q8CG70 732 aa26.97■■□□□ 1.91
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 ErbinQ80TH2 1402 aa26.9■■□□□ 1.9
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Psme1P97371 249 aa26.89■■□□□ 1.9
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa26.88■■□□□ 1.89
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sall3Q62255 1320 aa26.87■■□□□ 1.89
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
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