RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXL6	Q8N531	539 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PHKB	Q93100	1093 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	OAT	P04181	439 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	FGFR4	P22455	802 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CIITA	P33076	1130 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	GPC3	P51654	580 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKCE	Q02156	737 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	DRP2	Q13474	957 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	BRF1	Q92994	677 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	GJA10	Q969M2	543 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF558	Q96NG5	402 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	MSH4	O15457	936 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEB2	O15479	319 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT32	Q14532	448 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	NTRK3	Q16288	839 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZUG5	572 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM167A	Q96KS9	214 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM150B	A6NC51	233 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXA2	O43364	376 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CHMP2A	O43633	222 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PPM1A	P35813	382 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPN5	P54829	565 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	FGD1	P98174	961 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNB2	Q92953	911 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC45	O75419	566 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	GNA11	P29992	359 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	ABI1	Q8IZP0	508 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC5A5	Q92911	643 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	POMK	Q9H5K3	350 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0U1RQF3	1178 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	GAS7	O60861	476 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	STBD1	O95210	358 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	WEE2	P0C1S8	567 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TMOD1	P28289	359 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	RIT2	Q99578	217 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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