RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 GDF3Q9NR23 364 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 BTBD19C9JJ37 291 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 F8W031 263 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 C6orf229H3BNL8 230 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MATN2O00339 956 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 BACH1O14867 736 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CYTH3O43739 400 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ASMTLO95671 621 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TPBGLP0DKB5 382 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 RGS2P41220 211 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PLCD1P51178 756 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 BNIP1Q12981 228 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM29Q14134 588 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CNGA3Q16281 694 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 KRT71Q3SY84 523 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 KANK3Q6NY19 840 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MICU3Q86XE3 530 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 HINFPQ9BQA5 517 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CACNA1FO60840 1977 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 C4AP0C0L4 1744 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP3K7O43318 606 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TBCAO75347 108 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 VAV1P15498 845 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ERVK-24P63145 666 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TNNC1P63316 161 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SPA17Q15506 151 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ADRM1Q16186 407 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SPATA1Q5VX52 437 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ANO1Q5XXA6 986 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF2BQ8N4N8 673 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MPP4Q96JB8 637 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SELENOSQ9BQE4 189 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 HESX1Q9UBX0 185 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 FGAP02671 866 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 NAT2P11245 290 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 HALP42357 657 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CASP7P55210 303 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PDE4BQ07343 736 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SCARF1Q14162 830 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 APPBP2Q92624 585 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF333Q96JL9 665 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CHD4Q14839 1912 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 A8MUI8 341 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SNAP23O00161 211 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF185O15231 689 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 OCRLQ01968 901 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF22Q14807 665 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 C11orf74Q86VG3 221 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 NAT14Q8WUY8 206 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM136AQ96C01 138 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ITPKCQ96DU7 683 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PBKQ96KB5 322 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 NAPBQ9H115 298 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 GPR108Q9NPR9 543 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CUL1Q13616 776 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 165.4 ms