RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	MKL1	Q969V6	931 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	AIFM3	Q96NN9	605 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTA3	Q9BTC8	594 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	PICK1	Q9NRD5	415 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	NID2	Q14112	1375 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RABGGTB-212	ENST00000491266	LAMB1	P07942	1786 aa		7.15	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		7.15	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYTH3	O43739	400 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNHG28	P0DPA3	235 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	BMP3	P12645	472 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GATA4	P43694	442 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP11	P51784	963 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFAIP1	Q13829	316 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PKN1	Q16512	942 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CST9	Q5W186	159 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSCB	Q8IWL3	235 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	FANCB	Q8NB91	859 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATG4C	Q96DT6	458 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC17	Q96LX7	622 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TM9SF2	Q99805	663 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	NYAP2	Q9P242	653 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYH1	P12882	1939 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLF4	O43474	513 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRIG2	O94898	1065 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFIC	P08651	508 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDHB	P11177	359 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB6A	P20340	208 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCM2	P49736	904 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MOGS	Q13724	837 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRM4	Q14833	912 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD1	Q15327	319 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MICU3	Q86XE3	530 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHKB	Q93100	1093 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMX2	Q9Y320	296 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB43	O43298	467 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDAH1	O94760	285 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTLL1	O95922	423 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFB10	O96000	172 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	ICA1	Q05084	483 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	VGLL4	Q14135	290 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP7	Q14244	749 aa		7.12	□□□□□ -1.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms