RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 MYH4Q9Y623 1939 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CFAP73A6NFT4 308 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 A8MUI8 341 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 E9PMD0 336 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TRAF5O00463 557 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 EVI5O60447 810 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SLCO1A2P46721 670 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SNX1Q13596 522 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 GNPTABQ3T906 1256 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 KRT79Q5XKE5 535 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 MGARPQ8TDB4 240 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ECT2Q9H8V3 914 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 STAT3P40763 770 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 INHBEP58166 350 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 HOOK3Q86VS8 718 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ERICH1Q86X53 443 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 FMO2Q99518 471 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 MTFR1LQ9H019 292 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SHBGP04278 402 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R2P41236 205 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PEX26Q7Z412 305 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SP8Q8IXZ3 490 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PROM2Q8N271 834 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 STK17AQ9UEE5 414 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ADCY2Q08462 1091 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 KCNMA1Q12791 1236 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 METTL13Q8N6R0 699 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PBKQ96KB5 322 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TSG101Q99816 390 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 COA1Q9GZY4 146 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 GSTA1P08263 222 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 MYBP10242 640 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 RIPK1Q13546 671 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TAF11Q15544 211 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SCFD2Q8WU76 684 aa14.6□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.071e-7■□□□□ 10.6
NISCH-212ENST00000488380 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 POTEB3A0JP26 581 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 POTECB2RU33 542 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 MARCH6O60337 910 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 COASYQ13057 564 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SLMAPQ14BN4 828 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ASIC2Q16515 512 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 POTEBQ6S5H4 581 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 AZI2Q9H6S1 392 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CEP72Q9P209 647 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB5O15062 677 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 USP11P51784 963 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PLTPP55058 493 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ATP11AP98196 1134 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PDIA5Q14554 519 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 LRRC14Q15048 493 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 DENND2CQ68D51 928 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ASAP2O43150 1006 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CCND1P24385 295 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 COPB2P35606 906 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CCDC38Q502W7 563 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ETAA1Q9NY74 926 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms