RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF185O15231 689 aa17.83■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEPT6Q14141 434 aa17.83■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSTA2P09210 222 aa17.83■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SALL3Q9BXA9 1300 aa17.82■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GTH6 734 aa17.82■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C4orf50Q6ZRC1 276 aa17.82■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAPH1Q70E73 1250 aa17.81■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TC2NQ8N9U0 490 aa17.8■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VAMP7P51809 220 aa17.8■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENGASEQ8NFI3 743 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSPH1Q92598 858 aa17.8■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF543Q08ER8 600 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALCAMQ13740 583 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNB1Q14721 858 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDIK1LQ8N165 341 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCPH1Q8NEM0 835 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TFR2Q9UP52 801 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PQC6 194 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA8MH3BSY2 632 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC4A1P02730 911 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 E2F4Q16254 413 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM47EQ6ZV65 393 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PYROXD1Q8WU10 500 aa17.8■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MON2Q7Z3U7 1717 aa17.8■□□□□ 0.44
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