RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTERF2Q49AM1 385 aa29.46■■■□□ 2.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa29.46■■■□□ 2.31
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THNSL1Q8IYQ7 743 aa29.44■■■□□ 2.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRIP1P48552 1158 aa29.43■■■□□ 2.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DRP2Q13474 957 aa29.43■■■□□ 2.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADHFE1Q8IWW8 467 aa29.43■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa29.43■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CWH43Q9H720 699 aa29.43■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM86C2PA6NEL3 165 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANAPC15P60006 121 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEK8Q86SG6 692 aa29.42■■■□□ 2.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASD1Q96PB1 797 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP89Q96ST8 783 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH2D3AQ9BRG2 576 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLE6Q9H808 572 aa29.41■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJB4Q9NTQ9 266 aa29.41■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF19AQ9NV58 838 aa29.41■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.41■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa29.4■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf67A6NJJ6 358 aa29.4■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP2R5CQ13362 524 aa29.4■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSLNLQ96KJ4 702 aa29.4■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNMB3Q9NPA1 279 aa29.4■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DACT1Q9NYF0 836 aa29.4■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EML1O00423 815 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DTNBO60941 627 aa29.39■■■□□ 2.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC55Q6ZSA7 311 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANO5Q75V66 913 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC43Q8N309 656 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OXER1Q8TDS5 423 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC1BQ9P126 229 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VAV3Q9UKW4 847 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A087WZ62 844 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0U1RQF3 1178 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTDNEP1O95476 244 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 QARSP47897 775 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVFC1P60507 584 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WASF1Q92558 559 aa29.38■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
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