RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KSR1Q8IVT5 923 aa24■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABRAQ8N0Z2 381 aa24■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACCSQ96QU6 501 aa24■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.99■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SORBS3O60504 671 aa23.99■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OATP04181 439 aa23.99■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASP4P49662 377 aa23.99■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR78Q5VTH9 848 aa23.99■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR59Q6PJI9 974 aa23.99■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.99■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.99■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.99■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.99■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASB14A6NK59 587 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GGPS1O95749 300 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP4AP20648 1035 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMTNP53814 917 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PEX3P56589 373 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEK11Q8NG66 645 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IKZF4Q9H2S9 585 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UQCRHLA0A096LP55 91 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPHB6O15197 1021 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UQCRHP07919 91 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC35C1Q96A29 364 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DESI2Q9BSY9 194 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.98■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STRNO43815 780 aa23.97■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPTX2P47972 431 aa23.97■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CST9Q5W186 159 aa23.97■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.97■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.97■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.97■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYRIPQ8NFW9 859 aa23.97■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.97■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCYT2Q99447 389 aa23.97■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.97■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARIH2O95376 493 aa23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BAP1Q92560 729 aa23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHP1Q99653 195 aa23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP72Q9P209 647 aa23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC16A4O15374 487 aa23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LY6KQ17RY6 165 aa23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.96■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOL4O94818 638 aa23.95■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCD1P33897 745 aa23.95■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP2R5AQ15172 486 aa23.95■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM65Q6PJ69 517 aa23.95■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BSNDQ8WZ55 320 aa23.95■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNN1Q92952 543 aa23.95■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN18Q99952 460 aa23.95■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.95■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPME1Q9Y570 386 aa23.95■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDUFA10O95299 355 aa23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADORA2AP29274 412 aa23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAT5BP51692 787 aa23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTERF2Q49AM1 385 aa23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC170Q8IYT3 715 aa23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF18AQ8NI77 898 aa23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP89Q96ST8 783 aa23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBX20Q9UMR3 447 aa23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LGR5O75473 907 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCP2P22307 547 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP2J2P51589 502 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EMC2Q15006 297 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms