RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 KRT39Q6A163 491 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 ARMT1Q9H993 441 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 GMNCA6NCL1 334 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 CA4P22748 312 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF556Q9HAH1 456 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 SCN3BQ9NY72 215 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 PIK3R2O00459 728 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 GPAA1O43292 621 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 AKR1D1P51857 326 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP4A11Q02928 519 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 KRT33BQ14525 404 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 STKLD1Q8NE28 680 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 EPC1Q9H2F5 836 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 UBE4BO95155 1302 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 CROCC2H7BZ55 1655 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 ECEL1O95672 775 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 NEK9Q8TD19 979 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 RUBCNLQ9H714 662 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.89□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 EXOC3O60645 756 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 SNX2O60749 519 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 PLCG2P16885 1265 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF827Q17R98 1081 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 BBS5Q8N3I7 341 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 PBKQ96KB5 322 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 DNM3Q9UQ16 869 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 SGO2Q562F6 1265 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 TMC2Q8TDI7 906 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 KCTD6Q8NC69 237 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 FKBP14Q9NWM8 211 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 RFX8Q6ZV50 586 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 MNTQ99583 582 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 ERAP1Q9NZ08 941 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 LAMC1P11047 1609 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 GGCXP38435 758 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 ME3Q16798 604 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 C10orf76Q5T2E6 689 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 RWDD2AQ9UIY3 292 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 HADHAP40939 763 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 TAB1Q15750 504 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 MAPKAPK2P49137 400 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 EFR3AQ14156 821 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 RBBP7Q16576 425 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 CLEC4FQ8N1N0 589 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 RASSF5Q8WWW0 418 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 LSM1O15116 133 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 RNMTO43148 476 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 ABL1P00519 1130 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 TTC38Q5R3I4 469 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 TRIM51Q9BSJ1 452 aa11.88□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 CRYMQ14894 314 aa11.87□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 EME1Q96AY2 570 aa11.87□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 AKAP5P24588 427 aa11.87□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.87□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.87□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.87□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 USP19O94966 1318 aa11.87□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 RPS6P62753 249 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 RASSF7Q02833 373 aa11.87□□□□□ -0.51
HDGFL3-201ENST00000299633 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms