RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 INHBAP08476 426 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 GPC5P78333 572 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 KCNH2Q12809 1159 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 EMBQ6PCB8 327 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 LXNQ9BS40 222 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 APOL6Q9BWW8 343 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-228ENST00000636120 SHPRHQ149N8 1683 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PFASO15067 1338 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 STXBP3O00186 592 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CLDN3O15551 220 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TJP3O95049 919 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GGPS1O95749 300 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 DPYDQ12882 1025 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ERICH1Q86X53 443 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ESYT2A0FGR8 921 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 FTCDO95954 541 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CDC42EP1Q00587 391 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TAP1Q03518 808 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TTC13Q8NBP0 860 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 VCX3BQ9H321 246 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GPD1LQ8N335 351 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SLIT3O75094 1523 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 A0A087WWV3 80 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC53A6NM62 1247 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 EFNA5P52803 228 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ANTXR2P58335 489 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ITKQ08881 620 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ZSCAN26Q16670 478 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 LDHDQ86WU2 507 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 MGARPQ8TDB4 240 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 FAM151AQ8WW52 585 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 RILPQ96NA2 401 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 DONSONQ9NYP3 566 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SH3BP5O60239 455 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CPP00450 1065 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 FCER1AP12319 257 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PPP2R5DQ14738 602 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PXDNQ92626 1479 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 EVI5O60447 810 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 RHOBTB3O94955 611 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TDP2O95551 362 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 MYL3P08590 195 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GUCY1A2P33402 732 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ADCY2Q08462 1091 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 BEST2Q8NFU1 509 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 RASA1P20936 1047 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CIITAP33076 1130 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
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