RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM87AP0C7U9 286 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE6AP16499 860 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PAMP19021 973 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC9A1P19634 815 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 LSP1P33241 339 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 USP14P54578 494 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PHC1P78364 1004 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PDCD1Q15116 288 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CRY1Q16526 586 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 OSTM1Q86WC4 334 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 NGEFQ8N5V2 710 aa5.12□□□□□ -1.59
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CAPNS1-210ENST00000590211 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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CAPNS1-210ENST00000590211 TAAR9Q96RI9 348 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 BOCQ9BWV1 1114 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CDIP1Q9H305 208 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PHTF1Q9UMS5 762 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 DNM3Q9UQ16 869 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 INVSQ9Y283 1065 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CGNL1Q0VF96 1302 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 AKAP12Q02952 1782 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 RASSF10A6NK89 507 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 AP1G1O43747 822 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF205O95201 554 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 AKAP5P24588 427 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 RAPGEF1Q13905 1077 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ACAP2Q15057 778 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 NFKBIBQ15653 356 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CLUL1Q15846 466 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.11□□□□□ -1.59
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CAPNS1-210ENST00000590211 USHBP1Q8N6Y0 703 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
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CAPNS1-210ENST00000590211 PARD3BQ8TEW8 1205 aa5.11□□□□□ -1.59
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CAPNS1-210ENST00000590211 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNJ15Q99712 375 aa5.11□□□□□ -1.59
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CAPNS1-210ENST00000590211 TERF2IPQ9NYB0 399 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 POGKQ9P215 609 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTS8Q9UP79 889 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TNRQ92752 1358 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCC11Q96J66 1382 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP7BP35670 1465 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 IQSEC2Q5JU85 1478 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ADGRB2O60241 1585 aa5.11□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PP64 1363 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC12A8A0AV02 714 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 LCHNA4D1U4 455 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 A6NNZ2 444 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 WASH4PA8MWX3 477 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 WIPF1O43516 503 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 TCEA3O75764 348 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 AMY2AP04746 511 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 AMY2BP19961 511 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 RXRBP28702 533 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 JAM2P57087 298 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 GJA9P57773 515 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ADCY1Q08828 1119 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 LSAMPQ13449 338 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ZMYM3Q14202 1370 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 BEND4Q6ZU67 534 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CPNE8Q86YQ8 564 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC10AQ8IUN9 316 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.1□□□□□ -1.59
CAPNS1-210ENST00000590211 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
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