RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 DLG3Q92796 817 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 USP7Q93009 1102 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 CLIC6Q96NY7 704 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 NEMP1O14524 444 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ZEB2O60315 1214 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 BRINP1O60477 761 aa6.86□□□□□ -1.31
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TRDN-204ENST00000542443 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.86□□□□□ -1.31
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TRDN-204ENST00000542443 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 SEC23AQ15436 765 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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TRDN-204ENST00000542443 TTC1Q99614 292 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 IFT22Q9H7X7 185 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 OXSMQ9NWU1 459 aa6.86□□□□□ -1.31
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TRDN-204ENST00000542443 MCM8Q9UJA3 840 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ACOT7O00154 380 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 SCDO00767 359 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 DVL2O14641 736 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 FKBP9O95302 570 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 LRG1P02750 347 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ZNF28P17035 718 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 GJA4P35212 333 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 LSSP48449 732 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ANAPC15P60006 121 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 CPZQ66K79 652 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.85□□□□□ -1.31
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TRDN-204ENST00000542443 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 CEP162Q5TB80 1403 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 C9orf118A6NHY6 69 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 H7C1D1 291 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 HIP1RO75146 1068 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 KRT37O76014 449 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 IL2P60568 153 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 OCRLQ01968 901 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 GRIN1Q05586 938 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 STAT4Q14765 748 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 EFHBQ8N7U6 833 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 CHST13Q8NET6 341 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 ATL2Q8NHH9 583 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 SAMD11Q96NU1 681 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 TMEM209Q96SK2 561 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRDN-204ENST00000542443 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.84□□□□□ -1.31
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TRDN-204ENST00000542443 ID4P47928 161 aa6.83□□□□□ -1.32
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TRDN-204ENST00000542443 WASF3Q9UPY6 502 aa6.83□□□□□ -1.32
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TRDN-204ENST00000542443 LAMTOR5O43504 91 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 TGM5O43548 720 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 SDHAP31040 664 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 KIF11P52732 1056 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 ZNF174Q15697 407 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 SCYL1Q96KG9 808 aa6.82□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TRDN-204ENST00000542443 ACSS2Q9NR19 701 aa6.82□□□□□ -1.32
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