RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 METTL13Q8N6R0 699 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 IL23AQ9NPF7 189 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 PP2D1A8MPX8 630 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 CAND2O75155 1236 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 MED24O75448 989 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 RSPH10BP0C881 870 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 BMP8BP34820 402 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 PRO3102Q9H379 93 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-255ENST00000498007 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 RFC2P35250 354 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 CLCN3P51790 818 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 NPEPPSP55786 919 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 POTEGQ6S5H5 508 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 CEP170P1Q96L14 293 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 USP28Q96RU2 1077 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 EVPLQ92817 2033 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 ZBTB39O15060 712 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 MAGEB2O15479 319 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 PDIA5Q14554 519 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 XKR9Q5GH70 373 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 A0A087WWV3 80 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 M0QZ92 97 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 NBNO60934 754 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 LYPLA2O95372 231 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 RPA1P27694 616 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 CDC25AP30304 524 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 MBTPS1Q14703 1052 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 PTPAQ15257 358 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 KRT79Q5XKE5 535 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 RPAINQ86UA6 219 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 TDHQ8IZJ6 230 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 AKT3Q9Y243 479 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 PFKMP08237 780 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 TMOD1P28289 359 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 MGAT3Q09327 533 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 SHHQ15465 462 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF365Q70YC5 407 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 CEP89Q96ST8 783 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 MAP7D2Q96T17 732 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 STK24Q9Y6E0 443 aa22.11■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 BRD1O95696 1058 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 CHRNA1P02708 482 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 VTNP04004 478 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 GRIN1Q05586 938 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 GPNMBQ14956 572 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 FAM26DQ5JW98 314 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM240Q5SV17 173 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 IER5Q5VY09 327 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 VWCEQ96DN2 955 aa22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HLA-B-255ENST00000498007 GINS2Q9Y248 185 aa22.1■■□□□ 1.13
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