RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 TBX3O15119 743 aa20.51■□□□□ 0.87
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PTX4-201ENST00000293922 MCM4P33991 863 aa20.51■□□□□ 0.87
PTX4-201ENST00000293922 PRPHP41219 470 aa20.51■□□□□ 0.87
PTX4-201ENST00000293922 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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PTX4-201ENST00000293922 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.5■□□□□ 0.87
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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PTX4-201ENST00000293922 KRT76Q01546 638 aa20.44■□□□□ 0.86
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PTX4-201ENST00000293922 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.44■□□□□ 0.86
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PTX4-201ENST00000293922 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.44■□□□□ 0.86
PTX4-201ENST00000293922 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
PTX4-201ENST00000293922 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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