RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587190.5

NEDD4L-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-216	ENST00000587190	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NEDD4L-216	ENST00000587190	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NEDD4L-216	ENST00000587190	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NEDD4L-216	ENST00000587190	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NEDD4L-216	ENST00000587190	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NEDD4L-216	ENST00000587190	NFASC	O94856	1347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NEDD4L-216	ENST00000587190	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NEDD4L-216	ENST00000587190	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	PGK2	P07205	417 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	KCNA2	P16389	499 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	CYP11B2	P19099	503 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	PRCP	P42785	496 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	PORCN	Q9H237	461 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	PANK4	Q9NVE7	773 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	ASTN1	O14525	1302 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	AP5Z1	O43299	807 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	ATP9A	O75110	1047 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SLITRK3	O94933	977 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SERPINC1	P01008	464 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	TPM3	P06753	285 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	PSAP	P07602	524 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SLC10A3	P09131	477 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	EDNRB	P24530	442 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	ICAM3	P32942	547 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	PSMC6	P62333	389 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SP4	Q02446	784 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	PSMD2	Q13200	908 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	ASB14	A6NK59	587 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	RGS20	O76081	388 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	FAM13A	O94988	1023 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	CCNE2	O96020	404 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	CDC25B	P30305	580 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	PSMC5	P62195	406 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	FANCC	Q00597	558 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SREBF2	Q12772	1141 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	ADSSL1	Q8N142	457 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	REEP2	Q9BRK0	252 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	FANCL	Q9NW38	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	IFNK	Q9P0W0	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	SORBS3	O60504	671 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	KIF20A	O95235	890 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	GAP43	P17677	238 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	ADORA2A	P29274	412 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	MAPK4	P31152	587 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	STK4	Q13043	487 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	NEDD9	Q14511	834 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-216	ENST00000587190	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.55	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms