RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 SPEF2Q9C093 1822 aa9.06□□□□□ -0.96
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PTPRD-211ENST00000486161 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
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PTPRD-211ENST00000486161 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRD-211ENST00000486161 NIPA1Q7RTP0 329 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB33Q86T24 672 aa9.04□□□□□ -0.96
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