RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC16A2P36021 539 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-208ENST00000471759 TUBP50607 506 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-208ENST00000471759 HTRA3P83110 453 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-208ENST00000471759 E2F2Q14209 437 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-208ENST00000471759 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-208ENST00000471759 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.16□□□□□ -1.26
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RABGGTB-208ENST00000471759 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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RABGGTB-208ENST00000471759 MAP3K14Q99558 947 aa7.16□□□□□ -1.26
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RABGGTB-208ENST00000471759 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-208ENST00000471759 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTB-208ENST00000471759 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.261e-7■□□□□ 10.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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RABGGTB-208ENST00000471759 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-208ENST00000471759 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-208ENST00000471759 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.261e-6■■■□□ 15.9
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RABGGTB-208ENST00000471759 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-208ENST00000471759 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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RABGGTB-208ENST00000471759 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
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RABGGTB-208ENST00000471759 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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RABGGTB-208ENST00000471759 ATP5DP30049 168 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-208ENST00000471759 RGS2P41220 211 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-208ENST00000471759 TNNI2P48788 182 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNQ4P56696 695 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-208ENST00000471759 GUCY2DQ02846 1103 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-208ENST00000471759 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-208ENST00000471759 C4orf46Q504U0 113 aa7.14□□□□□ -1.27
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