RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJB3Q8WWF6 145 aa27.1■■□□□ 1.93
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SMKR1-201ENST00000462322 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 CHMP2AO43633 222 aa27.09■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 EFCAB14O75071 495 aa27.09■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 DBF4BQ8NFT6 615 aa27.09■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 SLC28A3Q9HAS3 691 aa27.09■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 DISC1Q9NRI5 854 aa27.09■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 GABBR1Q9UBS5 961 aa27.09■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
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SMKR1-201ENST00000462322 NR5A1Q13285 461 aa27.08■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa27.08■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 HERC6Q8IVU3 1022 aa27.08■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 SEPT8Q92599 483 aa27.08■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 UNC45AQ9H3U1 944 aa27.08■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
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SMKR1-201ENST00000462322 SFNP31947 248 aa27.07■■□□□ 1.92
SMKR1-201ENST00000462322 JAK3P52333 1124 aa27.07■■□□□ 1.92
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNF484Q5JVG2 852 aa27.07■■□□□ 1.92
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SMKR1-201ENST00000462322 GHRP10912 638 aa27.03■■□□□ 1.92
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SMKR1-201ENST00000462322 B3GNT9Q6UX72 402 aa27.01■■□□□ 1.91
SMKR1-201ENST00000462322 C8orf76Q96K31 380 aa27.01■■□□□ 1.91
SMKR1-201ENST00000462322 PRDM12Q9H4Q4 367 aa27.01■■□□□ 1.91
SMKR1-201ENST00000462322 TRPV2Q9Y5S1 764 aa27.01■■□□□ 1.91
SMKR1-201ENST00000462322 COL6A3P12111 3177 aa27.01■■□□□ 1.91
SMKR1-201ENST00000462322 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
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