RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461405.1

PHF20-208, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 2

Gene PHF20, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-208	ENST00000461405	GRIK4	Q16099	956 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	TREH	O43280	583 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	EVI5	O60447	810 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	MED24	O75448	989 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	SLITRK3	O94933	977 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	BMP15	O95972	392 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	CYP2C9	P11712	490 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	ITGB8	P26012	769 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	PSMC5	P62195	406 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	ANO5	Q75V66	913 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	COL1A2	P08123	1366 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	HBP1	O60381	514 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	LYPLA2	O95372	231 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	SYN1	P17600	705 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	CDC25A	P30304	524 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	RBL2	Q08999	1139 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	ECM1	Q16610	540 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	PTGIS	Q16647	500 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	DPF3	Q92784	378 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	FAM167A	Q96KS9	214 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	ZBTB39	O15060	712 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	C22orf31	O95567	290 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	IGBP1	P78318	339 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	XKR3	Q5GH77	459 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PHF20-208	ENST00000461405	YEATS4	O95619	227 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	RPA1	P27694	616 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	PTK7	Q13308	1070 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	PDIA5	Q14554	519 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	LRRC15	Q8TF66	581 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405		A0A087WWV3	80 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PHF20-208	ENST00000461405	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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