RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570051.5

RNPS1-226, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-226ENST00000570051 SCN5AQ14524 2016 aa23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 TREHO43280 583 aa23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 GAS7O60861 476 aa23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 PSMD10O75832 226 aa23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 ADAM17P78536 824 aa23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 SHHQ15465 462 aa23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 WDR81Q562E7 1941 aa23.37■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 BACH1O14867 736 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 GNAT1P11488 350 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 SLC26A2P50443 739 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 PPFIA1Q13136 1202 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 RETREG2Q8NC44 543 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 IL23AQ9NPF7 189 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.36■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 WDR64B1ANS9 1081 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 IQCF3P0C7M6 154 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 PLCB4Q15147 1175 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 GRIK4Q16099 956 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 VWCEQ96DN2 955 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.334e-6■□□□□ 10.6
RNPS1-226ENST00000570051 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF302Q9NR11 478 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 PSAPP07602 524 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 ACRP10323 421 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 CKBP12277 381 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 TMEM240Q5SV17 173 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 POTEDQ86YR6 584 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 DISC1Q9NRI5 854 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 TRPC6Q9Y210 931 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 KIF3AQ9Y496 699 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 SAMM50Q9Y512 469 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 WNT7AO00755 349 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 TBX3O15119 743 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 CHMP2AO43633 222 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 INSRRP14616 1297 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 SELPP16109 830 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 GJB2P29033 226 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 SFNP31947 248 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 RFC2P35250 354 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 JAK3P52333 1124 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 FAM20AQ96MK3 541 aa23.33■■□□□ 1.33
RNPS1-226ENST00000570051 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.33■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 POTEB3A0JP26 581 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 ATP4AP20648 1035 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 CUL4AQ13619 759 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 POTEBQ6S5H4 581 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF365Q70YC5 407 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 RDM1Q8NG50 284 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 HAS1Q92839 578 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 TET1Q8NFU7 2136 aa23.32■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.31■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 KIF28PB7ZC32 967 aa23.31■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 PFKMP08237 780 aa23.31■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.31■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.31■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 VAV3Q9UKW4 847 aa23.31■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 HBP1O60381 514 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 THPOP40225 353 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 IGBP1P78318 339 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 GPNMBQ14956 572 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 CAND2O75155 1236 aa23.29■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 FGBP02675 491 aa23.29■■□□□ 1.32
RNPS1-226ENST00000570051 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
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