RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 POTEMA6NI47 508 aa15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 LGR5O75473 907 aa15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 F2P00734 622 aa15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 MARK3P27448 753 aa15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.022e-6■□□□□ 9.9
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CCNDBP1-209ENST00000566833 PSMC6P62333 389 aa15.16■□□□□ 0.02
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CCNDBP1-209ENST00000566833 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 B3GNT9Q6UX72 402 aa15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.16■□□□□ 0.02
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CCNDBP1-209ENST00000566833 STK24Q9Y6E0 443 aa15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 EML1O00423 815 aa15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 SPTLC2O15270 562 aa15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 CAPN15O75808 1086 aa15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 YEATS4O95619 227 aa15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC26A2P50443 739 aa15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 SPIRE1Q08AE8 756 aa15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 ITGA7Q13683 1181 aa15.15■□□□□ 0.02
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CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC39A14Q15043 492 aa15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 PTPAQ15257 358 aa15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 HAUS3Q68CZ6 603 aa15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 C7orf31Q8N865 590 aa15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 NEK9Q8TD19 979 aa15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRPC6Q9Y210 931 aa15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa15.14■□□□□ 0.01
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CCNDBP1-209ENST00000566833 COL6A1P12109 1028 aa15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 QARSP47897 775 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 PSMC5P62195 406 aa15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 CYP4A11Q02928 519 aa15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 NBPF20Q3BBV1 942 aa15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 KRT79Q5XKE5 535 aa15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 LINC00301Q8NCQ3 95 aa15.14■□□□□ 0.01
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CCNDBP1-209ENST00000566833 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 AFAP1L1Q8TED9 768 aa15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 KAT2BQ92831 832 aa15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 DYDC2Q96IM9 177 aa15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM167AQ96KS9 214 aa15.14■□□□□ 0.01
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CCNDBP1-209ENST00000566833 HTATIP2Q9BUP3 242 aa15.14■□□□□ 0.01
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CCNDBP1-209ENST00000566833 RASSF8Q8NHQ8 419 aa15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 SNX29Q8TEQ0 813 aa15.13■□□□□ 0.01
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CCNDBP1-209ENST00000566833 AK8Q96MA6 479 aa15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 LXNQ9BS40 222 aa15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.13■□□□□ 0.01
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CCNDBP1-209ENST00000566833 RGL1Q9NZL6 768 aa15.13■□□□□ 0.01
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CCNDBP1-209ENST00000566833 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
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CCNDBP1-209ENST00000566833 POTEB3A0JP26 581 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 TLR3O15455 904 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 HBP1O60381 514 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 PPP6R2O75170 966 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 GNAT1P11488 350 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 TXLNAP40222 546 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 UBA7P41226 1012 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 ME1P48163 572 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRKCEQ02156 737 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 PPFIA1Q13136 1202 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 PLCB4Q15147 1175 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 IL17AQ16552 155 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 UGCGQ16739 394 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 POTEBQ6S5H4 581 aa15.12■□□□□ 0.01
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