RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 Q4G0T1 1027 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 LENG9Q96B70 501 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 TBX3O15119 743 aa22.52■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 SLC18A3Q16572 532 aa22.52■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.52■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.52■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.52■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 PALMO75781 387 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 SREBF1P36956 1147 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 GGCXP38435 758 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 ASIC2Q16515 512 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 MS4A14Q96JA4 679 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 A0A087X0T9 212 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 FAM228BP0C875 321 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 ACTN1P12814 892 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 DACT2Q5SW24 774 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 MCTP2Q6DN12 878 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 GANQ9H2C0 597 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 POLD4Q9HCU8 107 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 TSKSQ9UJT2 592 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 ECE2O60344 883 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 FTCDO95954 541 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 MYBP10242 640 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 KLRC1P26715 233 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 GMCL1Q96IK5 515 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 MRIQ9BWK5 157 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 MSH4O15457 936 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 GH2P01242 217 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 ZNF76P36508 570 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 NAB2Q15742 525 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 FAM20AQ96MK3 541 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 RSPH10BP0C881 870 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 BMP3P12645 472 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 C8orf74Q6P047 294 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 STIM2Q9P246 746 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 SLC9A1P19634 815 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 HOXD13P35453 343 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 SPAG5Q96R06 1193 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 JAG1P78504 1218 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 MSL1Q68DK7 614 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 RUBCNQ92622 972 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 AGPSO00116 658 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 SIPA1L1O43166 1804 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 OPLAHO14841 1288 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 GCNT3O95395 438 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 RGL1Q9NZL6 768 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 VAV3Q9UKW4 847 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 AKAP3O75969 853 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 UCHL3P15374 230 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 PTK2Q05397 1052 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.46■■□□□ 1.19
IMP4-208ENST00000460766 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.46■■□□□ 1.19
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