RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299572.9

CENPN-201, Transcript of centromere protein N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPN, Length 1,398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPN-201ENST00000299572 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 RCAN1P53805 252 aa23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 GRIK4Q16099 956 aa23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 PGBD1Q96JS3 809 aa23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 ANO3Q9BYT9 981 aa23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 COG5Q9UP83 839 aa23.27■■□□□ 1.32
CENPN-201ENST00000299572 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.27■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 RPAINQ86UA6 219 aa23.27■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 RSPH3Q86UC2 560 aa23.27■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 BARHL2Q9NY43 387 aa23.27■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.27■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 SMCO2A6NFE2 343 aa23.26■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 CDC27P30260 824 aa23.26■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 SDF4Q9BRK5 362 aa23.26■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.26■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 REV3LO60673 3130 aa23.25■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 CHRNA1P02708 482 aa23.25■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 AP3B2Q13367 1082 aa23.25■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 CEP55Q53EZ4 464 aa23.25■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.25■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.25■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 TOP1MTQ969P6 601 aa23.25■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 YME1L1Q96TA2 773 aa23.25■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 AZI2Q9H6S1 392 aa23.25■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 NFASCO94856 1347 aa23.24■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 COL4A6Q14031 1691 aa23.24■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 BMP1P13497 986 aa23.24■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 KCNQ1P51787 676 aa23.24■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 HLA-CQ95604 372 aa23.24■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 PCYT2Q99447 389 aa23.24■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.24■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 TMEM260Q9NX78 707 aa23.24■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.23■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 UPP2O95045 317 aa23.23■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 ARP10275 920 aa23.23■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 GHRP10912 638 aa23.23■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 SREBF1P36956 1147 aa23.23■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 IGBP1P78318 339 aa23.23■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 MGAT3Q09327 533 aa23.23■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.23■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 BRF1Q92994 677 aa23.23■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.22■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 INSRRP14616 1297 aa23.22■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 ACTR2P61160 394 aa23.22■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 APOBRQ0VD83 1088 aa23.22■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.22■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 SAMD11Q96NU1 681 aa23.22■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 TRPC6Q9Y210 931 aa23.22■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.22■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 MEIS1O00470 390 aa23.21■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 ST18O60284 1047 aa23.21■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 SCG2P13521 617 aa23.21■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 ZNF76P36508 570 aa23.21■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 AK2P54819 239 aa23.21■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 LPIN1Q14693 890 aa23.21■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 ANKRD1Q15327 319 aa23.21■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 FBXL16Q8N461 479 aa23.21■■□□□ 1.31
CENPN-201ENST00000299572 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.2■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.2■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 NID2Q14112 1375 aa23.2■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.2■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 STAT5BP51692 787 aa23.19■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 PLCB4Q15147 1175 aa23.19■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 EPC2Q52LR7 807 aa23.19■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.19■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.19■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.19■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.19■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.19■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 ESYT2A0FGR8 921 aa23.18■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.18■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CENPN-201ENST00000299572 M0QZ92 97 aa23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms