RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259750.8

TTBK1-201, Transcript of tau tubulin kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTBK1, Length 6,932 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTBK1-201ENST00000259750 BMP3P12645 472 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 FBXW4P57775 412 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 SZRD1Q7Z422 152 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 LEMD3Q9Y2U8 911 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ATP10DQ9P241 1426 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 RAD17O75943 681 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 LTKP29376 864 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 LCA5Q86VQ0 697 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 MYOM2P54296 1465 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 GOLGA8IPA6NC78 632 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 GOLGA8JA6NMD2 632 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 SLC39A14Q15043 492 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ZNF521Q96K83 1311 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 UBE3CQ15386 1083 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 EXOC4Q96A65 974 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 SIK1P57059 783 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 THEGQ9P2T0 379 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 KDM6BO15054 1643 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 EPHB4P54760 987 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 GYS2P54840 703 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ARID5BQ14865 1188 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 NPR1P16066 1061 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ZBED2Q9BTP6 218 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 DRC3Q9H069 523 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 UGGT1Q9NYU2 1555 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 PDE8BO95263 885 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 SUFUQ9UMX1 484 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 TMEM94Q12767 1356 aa17.11■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 LRRD1A4D1F6 860 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 C1orf228Q6PIY5 440 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 NLRP4Q96MN2 994 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 POLR3EQ9NVU0 708 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 SERPINB2P05120 415 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 C10orf76Q5T2E6 689 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ARL13BQ3SXY8 428 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 AK8Q96MA6 479 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ESRRBO95718 433 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 SLMAPQ14BN4 828 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 FAM81BQ96LP2 452 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 INTUQ9ULD6 942 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ARHGDIAP52565 204 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 TERF2Q15554 542 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 MAN2A1Q16706 1144 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 KIF19Q2TAC6 998 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 FRA10AC1Q70Z53 315 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 MSTO1Q9BUK6 570 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ARHGEF37A1IGU5 675 aa17.1■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 KLC3Q6P597 504 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ARMCX2Q7L311 632 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 GINM1Q9NU53 330 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 MAML1Q92585 1016 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 SEC31BQ9NQW1 1179 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 JRKLQ9Y4A0 524 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 IL17REQ8NFR9 667 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 CEP19Q96LK0 163 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 EFHD1Q9BUP0 239 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ABCB6Q9NP58 842 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 CHEK2O96017 543 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 VSTM4Q8IW00 320 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 OR6B3Q8NGW1 331 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 CCDC151A5D8V7 595 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ATG16L1Q676U5 607 aa17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 CASP8Q14790 479 aa17.08■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 KANSL2Q9H9L4 492 aa17.08■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 IREB2P48200 963 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 SEPT12Q8IYM1 358 aa17.08■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 DYNLL2Q96FJ2 89 aa17.08■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 CDHR1Q96JP9 859 aa17.08■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 GSDMAQ96QA5 445 aa17.08■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
TTBK1-201ENST00000259750 ZBED1O96006 694 aa17.08■□□□□ 0.32
TTBK1-201ENST00000259750 E2F4Q16254 413 aa17.08■□□□□ 0.32
TTBK1-201ENST00000259750 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms