RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233190.10

NDUFS1-201, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDUFS1, Length 11,819 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-201ENST00000233190 GRK3P35626 688 aa7.4□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 SLFN12LQ6IEE8 588 aa7.4□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.4□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.4□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.4□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 CFAP43Q8NDM7 1665 aa7.4□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ITGA6P23229 1130 aa7.4□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 DOK7Q18PE1 504 aa7.4□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.4□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 MCUQ8NE86 351 aa7.4□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.4□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 NESP48681 1621 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ATP10DQ9P241 1426 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 PTK2Q05397 1052 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ATG3Q9NT62 314 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 FBXO10Q9UK96 956 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 TLK1Q9UKI8 766 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ASB14A6NK59 587 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 STXBP3O00186 592 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 P4HA2O15460 535 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNF544Q6NX49 715 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 TREML1Q86YW5 311 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 SMIM23A6NLE4 172 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ITGAXP20702 1163 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 H7C4K7 107 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 DEXIO95424 95 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 CETPP11597 493 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 SP110Q9HB58 689 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 FSCBQ5H9T9 825 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 SEMA3EO15041 775 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ASNSP08243 561 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 IMPDH2P12268 514 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 DAB2P98082 770 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 IYDQ6PHW0 289 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 THNSL1Q8IYQ7 743 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 MCF2LO15068 1137 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 KRT72Q14CN4 511 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 PALB2Q86YC2 1186 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 STK33Q9BYT3 514 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ANAPC2Q9UJX6 822 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ESPNB1AK53 854 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ATL2Q8NHH9 583 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM71BQ8TC56 605 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 NLRP4Q96MN2 994 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 MID2Q9UJV3 735 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 SORBS3O60504 671 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 TDP2O95551 362 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ABCB4P21439 1286 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 PTGS1P23219 599 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 LAMB3Q13751 1172 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 POLA2Q14181 598 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 PPP2R5EQ16537 467 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 OSBP2Q969R2 916 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 SUN2Q9UH99 717 aa7.39□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 NUP160Q12769 1436 aa7.38□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.38□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 A0A1B0GW55 424 aa7.38□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 LDHAP00338 332 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.38□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.38□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.38□□□□□ -1.23
NDUFS1-201ENST00000233190 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms