RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592052.1

TMEM259-208, Transcript of transmembrane protein 259, human

Gene TMEM259, Length 1,637 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-208	ENST00000592052	DNM1L	O00429	736 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	CHMP2A	O43633	222 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	PRPH	P41219	470 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	PPP2R5C	Q13362	524 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	KCNA10	Q16322	511 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	WDR64	B1ANS9	1081 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	KPNA6	O60684	536 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	CFAP45	Q9UL16	551 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	SAMM50	Q9Y512	469 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	SFN	P31947	248 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	ATG7	O95352	703 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	MYL3	P08590	195 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	JAK3	P52333	1124 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	PTPA	Q15257	358 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	RDM1	Q8NG50	284 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	ASGR1	P07306	291 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	TEC	P42680	631 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	DISC1	Q9NRI5	854 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	PSAP	P07602	524 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	27.9	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	ACLY	P53396	1101 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	SLC39A14	Q15043	492 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	STK38	Q15208	465 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	RAB34	Q9BZG1	259 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	PHF24	Q9UPV7	400 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TMEM259-208	ENST00000592052	YEATS4	O95619	227 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	LGALS2	P05162	132 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	KRT85	P78386	507 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	AZI2	Q9H6S1	392 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	BACH1	O14867	736 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	CABYR	O75952	493 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	ZNF286B	P0CG31	522 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	PDIA5	Q14554	519 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	EML1	O00423	815 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	IL17A	Q16552	155 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	GLG1	Q92896	1179 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	FERMT2	Q96AC1	680 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	EMSY	Q7Z589	1322 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	POTEM	A6NI47	508 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	LGR5	O75473	907 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052		A0A1W2PQY0	241 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	SPTLC2	O15270	562 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	EPHA7	Q15375	998 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	TRIM50	Q86XT4	487 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	PCYT2	Q99447	389 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	ZNF302	Q9NR11	478 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052		H3BRB1	525 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	F2	P00734	622 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	STAT5B	P51692	787 aa		27.85	■■■□□ 2.05

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