RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 FBLIM1Q8WUP2 373 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 FAXDC2Q96IV6 333 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 LGR6Q9HBX8 967 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 CHST7Q9NS84 486 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 USP25Q9UHP3 1055 aa5.2□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 TAGLN3Q9UI15 199 aa5.2□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa5.2□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC189A1A4V9 331 aa5.19□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 C2orf71A6NGG8 1288 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 STXBP3O00186 592 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 MEIS1O00470 390 aa5.19□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 LEFTY1O75610 366 aa5.19□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 RBP3P10745 1247 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 LCP1P13796 627 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.584e-7■■■□□ 18.5
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CAPNS1-210ENST00000590211 CYP2C19P33261 490 aa5.19□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 PAK1Q13153 545 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 GTF2H3Q13889 308 aa5.19□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 GBX1Q14549 363 aa5.19□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.19□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 SLC5A5Q92911 643 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 INTUQ9ULD6 942 aa5.19□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.19□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 ALG1Q9BT22 464 aa5.18□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 DUSP23Q9BVJ7 150 aa5.18□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 MAF1Q9H063 256 aa5.18□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 OXSMQ9NWU1 459 aa5.18□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 RCAN3Q9UKA8 241 aa5.18□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 MKL2Q9ULH7 1088 aa5.18□□□□□ -1.58
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CAPNS1-210ENST00000590211 TULP4Q9NRJ4 1543 aa5.18□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC66A2RUB6 948 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 APAF1O14727 1248 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 WNT9AO14904 365 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 TGM5O43548 720 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 CFBP00751 764 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 FOSP01100 380 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 GSNP06396 782 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 SRFP11831 508 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 PLS3P13797 630 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 IFNGR1P15260 489 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 COL8A1P27658 744 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 DNM2P50570 870 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 USP11P51784 963 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT85P78386 507 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 GALEQ14376 348 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC32Q14392 662 aa5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
CAPNS1-210ENST00000590211 DDB1Q16531 1140 aa5.17□□□□□ -1.58
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