RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TBCKQ8TEA7 893 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 SCFD2Q8WU76 684 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX12PQ92771 950 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 PFASO15067 1338 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 MYH10P35580 1976 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 MYMKA6NI61 221 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF233A6NK53 670 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 VGLL3A8MV65 326 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAF5O00463 557 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 PDXKO00764 312 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAPPC3O43617 180 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 PALMO75781 387 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 NUDT17P0C025 328 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 GAP43P17677 238 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 ERCC3P19447 782 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 MUTP22033 750 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TECP42680 631 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC1A4P43007 532 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 HADHBP55084 474 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP2R2AP63151 447 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 AP3B2Q13367 1082 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 PDCLQ13371 301 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 ITIH4Q14624 930 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TCEAL1Q15170 157 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM47AQ5JRC9 791 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 C6orf89Q6UWU4 347 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 SLFN11Q7Z7L1 901 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CUL5Q93034 780 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 MTMR8Q96EF0 704 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 PGM2Q96G03 612 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 SGSM3Q96HU1 749 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 SPAG5Q96R06 1193 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CARD9Q9H257 536 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 BATF3Q9NR55 127 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 PANK4Q9NVE7 773 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 NFU1Q9UMS0 254 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 PLAAQ9Y263 795 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 PODXLO00592 558 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 ASAP2O43150 1006 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 ZMYND10O75800 440 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 GLI1P08151 1106 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 H2AFZP0C0S5 128 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 FCER1AP12319 257 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 RASA1P20936 1047 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 NF2P35240 595 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 ADCY2Q08462 1091 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 COASYQ13057 564 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 RIPK1Q13546 671 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 MYBPC2Q14324 1141 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 SNCBQ16143 134 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP85LQ5SZL2 805 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 H2AFVQ71UI9 128 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TAOK1Q7L7X3 1001 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT26Q7Z3Y9 468 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 TMC4Q7Z404 712 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-202ENST00000586851 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.44□□□□□ -1.06
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