RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, human

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS1-215	ENST00000480416	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	PRRX2	Q99811	253 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	ELP1	O95163	1332 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	MBTPS2	O43462	519 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	CYP2C9	P11712	490 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	AKR1A1	P14550	325 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	PSMC6	P62333	389 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	DEFB103A	P81534	67 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	ACAP1	Q15027	740 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	SPACA7	Q96KW9	195 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TNS1-215	ENST00000480416	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		4.03	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		4.03	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	STXBP3	O00186	592 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	LINC01565	O15544	149 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	STRN	O43815	780 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	LGR5	O75473	907 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	VCAM1	P19320	739 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PLS1	Q14651	629 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	GPNMB	Q14956	572 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TET1	Q8NFU7	2136 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ASTN1	O14525	1302 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416		A0A1W2PRG0	241 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	OPLAH	O14841	1288 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	CSPG5	O95196	566 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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