RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439500.5

SPAM1-205, Transcript of sperm adhesion molecule 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPAM1, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPAM1-205	ENST00000439500	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CPZ	Q66K79	652 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	MIER2	Q8N344	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ORAI2	Q96SN7	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	EPX	P11678	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ABCB4	P21439	1286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	AGXT	P21549	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	GRK3	P35626	688 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	IRF9	Q00978	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	POU4F1	Q01851	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	KPNA5	O15131	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	NCK2	O43639	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	NDUFS2	O75306	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	GDF11	O95390	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TIAF1	O95411	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	APP	P05067	770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	AKAP5	P24588	427 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	PEX2	P28328	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	MAN1A1	P33908	653 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	SEPHS1	P49903	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	SEC23A	Q15436	765 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TESK1	Q15569	626 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	SV2A	Q7L0J3	742 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500		H7C1D1	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TUSC2	O75896	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	NID1	P14543	1247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	RAB6A	P20340	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	KIF11	P52732	1056 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	PHC1	P78364	1004 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	KCTD2	Q14681	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TOMM20	Q15388	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CT83	Q5H943	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CCT6B	Q92526	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	RNF112	Q9ULX5	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	RASA4B	C9J798	803 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	RASA4	O43374	803 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	UBXN7	O94888	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	HRG	P04196	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	VCAM1	P19320	739 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	PDC	P20941	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	MTNR1B	P49286	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
SPAM1-205	ENST00000439500	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms