RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 WDR64B1ANS9 1081 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 KRT10P13645 584 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 NLRP4Q96MN2 994 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 H7C0C1 242 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 ATP5OP48047 213 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 MTMR1Q13613 665 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 COX16Q9P0S2 106 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 ALKQ9UM73 1620 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 LRRC41Q15345 812 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 ALX1Q15699 326 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 GPSM2P81274 684 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 CCDC38Q502W7 563 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 C7orf31Q8N865 590 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 VCXQ9H320 206 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 ATP1A2P50993 1020 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 SNCBQ16143 134 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM20AQ96MK3 541 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 GRIN3BO60391 1043 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 PLCG1P19174 1290 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 NEK9Q8TD19 979 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.28■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 CLIC2O15247 247 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 CDKL2Q92772 493 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 ESYT2A0FGR8 921 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 SNAP23O00161 211 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 ANXA13P27216 316 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 TTLL4Q14679 1199 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 ARHGAP24Q8N264 748 aa22.27■■□□□ 1.16
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NCKAP1-201ENST00000360982 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 BUB1O43683 1085 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 VSIG1Q86XK7 387 aa22.27■■□□□ 1.16
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF653Q96CK0 615 aa22.27■■□□□ 1.16
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NCKAP1-201ENST00000360982 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 CYP2D6P10635 497 aa22.27■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 LRRC63Q05C16 580 aa22.27■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.27■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.27■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.27■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 CDC23Q9UJX2 597 aa22.27■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ADGRB3O60242 1522 aa22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 MYL3P08590 195 aa22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ARL4AP40617 200 aa22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 VPS41P49754 854 aa22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.26■■□□□ 1.15
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NCKAP1-201ENST00000360982 ZBTB33Q86T24 672 aa22.26■■□□□ 1.15
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NCKAP1-201ENST00000360982 SETSIPP0DME0 302 aa22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 KLRC3Q07444 240 aa22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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NCKAP1-201ENST00000360982 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.26■■□□□ 1.15
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NCKAP1-201ENST00000360982 RNF139Q8WU17 664 aa22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.26■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 RNF40O75150 1001 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 MARK3P27448 753 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 RPS6KA2Q15349 733 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ATF2P15336 505 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 MAPK6Q16659 721 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 OTUD5Q96G74 571 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 MAPK4P31152 587 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 SFNP31947 248 aa22.25■■□□□ 1.15
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