RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 PYCARDQ9ULZ3 195 aa20.56■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 RPS6KA2Q15349 733 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.55■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.55■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 ABCB11O95342 1321 aa20.55■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.55■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.54■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 FDX1P10109 184 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 COX16Q9P0S2 106 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 MB21D1Q8N884 522 aa20.52■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 KRT1P04264 644 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 INHBAP08476 426 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 ZBTB33Q86T24 672 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 A0A1B0GUA9 196 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRE-201ENST00000254667 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRE-201ENST00000254667 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRE-201ENST00000254667 NDUFA10O95299 355 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRE-201ENST00000254667 FOXO4P98177 505 aa20.51■□□□□ 0.87
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