RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623271.1

KIFC3-235, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

Gene KIFC3, Length 2,393 nt, Biotype TEC, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-235ENST00000623271 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.83□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 OTOFQ9HC10 1997 aa14.83□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 TRAF5O00463 557 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 DNM2P50570 870 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 VGLL4Q14135 290 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 WDR59Q6PJI9 974 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 SH2D4AQ9H788 454 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 MYO6Q9UM54 1294 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 H3BQF6 201 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 PLCG1P19174 1290 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 CABP7Q86V35 215 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.82□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 ZBTB5O15062 677 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 OR52Z1P0C646 297 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 STAT2P52630 851 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 B4DLN1 442 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 ERLIN1O75477 346 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 TRIM9Q9C026 710 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 EXOC1Q9NV70 894 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.81□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 SMCO2A6NFE2 343 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 CCNE1P24864 410 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 HERVK_113P62684 666 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 MEA1Q16626 185 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 ZSCAN26Q16670 478 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 LETM2Q2VYF4 491 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 USH1GQ495M9 461 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 HDXQ7Z353 690 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 P2RX5Q93086 422 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 MTMR8Q96EF0 704 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 BICDL2A1A5D9 508 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 GNA11P29992 359 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 HMGCS2P54868 508 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 PDE4DQ08499 809 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 NUP58Q9BVL2 599 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 C6orf50Q9HD87 102 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 ABCB6Q9NP58 842 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 L1RE1Q9UN81 338 aa14.8□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 RASSF10A6NK89 507 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 TUBBP07437 444 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 VCAM1P19320 739 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 NF2P35240 595 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 VSNL1P62760 191 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 KRT83P78385 493 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 STK4Q13043 487 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 RETREG2Q8NC44 543 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 ELP3Q9H9T3 547 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 GINM1Q9NU53 330 aa14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 BACE1P56817 501 aa14.78□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 ASIC1P78348 528 aa14.78□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.78□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.78□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 CCDC174Q6PII3 467 aa14.78□□□□□ -0.04
KIFC3-235ENST00000623271 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms