RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 C12orf60Q5U649 245 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 BARHL2Q9NY43 387 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 STAM2O75886 525 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP57Q86XR8 500 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 DIP2AQ14689 1571 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 DDIT3P35638 169 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SARM1Q6SZW1 724 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM260Q9NX78 707 aa22.55■■□□□ 1.2
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PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFA10O95299 355 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 GUCY1A2P33402 732 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 GUCY2DQ02846 1103 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 UNC13DQ70J99 1090 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SESTD1Q86VW0 696 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 MXI1P50539 228 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 HHATQ5VTY9 493 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 IL25Q9H293 177 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 AKT3Q9Y243 479 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF8O76064 485 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 OSBPP22059 807 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CABS1Q96KC9 395 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PANX2Q96RD6 677 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 JCADQ9P266 1359 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 AKR1B1P15121 316 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGAP4P98171 946 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT81Q14533 505 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS72Q15906 364 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 MB21D1Q8N884 522 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 APOL6Q9BWW8 343 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CAPN9O14815 690 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 ITPK1Q13572 414 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 LGSNQ5TDP6 509 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT12Q99456 494 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 MED10Q9BTT4 135 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SHC4Q6S5L8 630 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF653Q96CK0 615 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 FYB2Q5VWT5 728 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 MIS12Q9H081 205 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PP2D1A8MPX8 630 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PSAPP07602 524 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRJ-208ENST00000615445 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRJ-208ENST00000615445 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 MFAP3LO75121 409 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB7AO95365 584 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CXCR5P32302 372 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 POTEDQ86YR6 584 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PPM1EQ8WY54 764 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 RMDN3Q96TC7 470 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 E9PMD0 336 aa22.51■■□□□ 1.19
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PTPRJ-208ENST00000615445 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 PRCPP42785 496 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 KAZNQ674X7 775 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 NTSR2O95665 410 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 PRR29P0C7W0 189 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 ADGRB1O14514 1584 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRJ-208ENST00000615445 HSPA1LP34931 641 aa22.51■■□□□ 1.19
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