RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR78Q5VTH9 848 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 IFT20Q8IY31 132 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRC43Q8N309 656 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ABHD8Q96I13 439 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CAPZA3Q96KX2 299 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 NEK1Q96PY6 1258 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 MMS19Q96T76 1030 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRC42Q9Y546 428 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 UTRNP46939 3433 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 GFPT2O94808 682 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 MYZAPP0CAP1 466 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 USP46P62068 366 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RASSF7Q02833 373 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 KRT32Q14532 448 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RCN1Q15293 331 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PKN1Q16512 942 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SH3GL1Q99961 368 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SLF1Q9BQI6 1058 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ITGB4P16144 1822 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PSMD14O00487 310 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ACADSP16219 412 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SMARCA1P28370 1054 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 MTF1Q14872 753 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 KLC3Q6P597 504 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 MLKLQ8NB16 471 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.47□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PKD1L3Q7Z443 1732 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 BIRC5O15392 142 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CHGBP05060 677 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SKIP12755 728 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RFC5P40937 340 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PDE1BQ01064 536 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 BIRC3Q13489 604 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF394Q53GI3 561 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 STKLD1Q8NE28 680 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 KLHL29Q96CT2 875 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CENPKQ9BS16 269 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 COPRSQ9NQ92 184 aa8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CASP14P31944 242 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 MUM1Q2TAK8 710 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 SOGA3Q5TF21 947 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 USP33Q8TEY7 942 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM89AQ96GI7 184 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF26B4DH59 902 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 CAPN15O75808 1086 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 TPPPO94811 219 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 CAMTA2O94983 1202 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 TNFRSF8P28908 595 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 HOXD12P35452 270 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 RHBDL3P58872 404 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 BPIFB4P59827 614 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 HAND2P61296 217 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 SULT2A1Q06520 285 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 CHST3Q7LGC8 479 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 RSPH3Q86UC2 560 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP4K1Q92918 833 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP6V0A1Q93050 837 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 OLFM3Q96PB7 478 aa8.46□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 USP28Q96RU2 1077 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms