RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590044.1

ELOCP28-201, Transcript of elongin C pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene ELOCP28, Length 317 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOCP28-201ENST00000590044 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 TTC6Q86TZ1 520 aa6.68□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 HID1Q8IV36 788 aa6.68□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 ASB2Q96Q27 587 aa6.68□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.68□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.68□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 NFIBO00712 420 aa6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 CTGFP29279 349 aa6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 CAP2P40123 477 aa6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 MTHFSP49914 203 aa6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 ABHD4Q8TB40 342 aa6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.67□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 SSC5DA1L4H1 1573 aa6.66□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.66□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 A0A087WZG4 1122 aa6.66□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 GIPC1O14908 333 aa6.66□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 ESR1P03372 595 aa6.66□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 HK2P52789 917 aa6.66□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 PDE4CQ08493 712 aa6.66□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.66□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 DPF2Q92785 391 aa6.66□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.66□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 RTL9Q8NET4 1388 aa6.66□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 A1BGP04217 495 aa6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 TCIRG1Q13488 830 aa6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 KCTD2Q14681 263 aa6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 CRY2Q49AN0 593 aa6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 LILRA6Q6PI73 481 aa6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 ASB16Q96NS5 453 aa6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.65□□□□□ -1.34
ELOCP28-201ENST00000590044 USP34Q70CQ2 3546 aa6.65□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 GFRA2O00451 464 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 FYB1O15117 783 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 SGPL1O95470 568 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 BRD1O95696 1058 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 TMEM253P0C7T8 217 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 ATP2B2Q01814 1243 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 MAP3K11Q16584 847 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 SV2BQ7L1I2 683 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 ANKS1AQ92625 1134 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 WNK4Q96J92 1243 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 Q96M66 194 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 RNF19AQ9NV58 838 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 ATRXP46100 2492 aa6.64□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 C5orf42Q9H799 3197 aa6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 TFRCP02786 760 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 CREG2Q8IUH2 290 aa6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 THEGQ9P2T0 379 aa6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.63□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.62□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 PGRP06401 933 aa6.62□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 RAC2P15153 192 aa6.62□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 CYP7A1P22680 504 aa6.62□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 KIR3DL1P43629 444 aa6.62□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 KCNA10Q16322 511 aa6.62□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 DEFB118Q96PH6 123 aa6.62□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 CD320Q9NPF0 282 aa6.62□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.61□□□□□ -1.35
ELOCP28-201ENST00000590044 SMIM22K7EJ46 135 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms