RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAPN7Q9Y6W3 813 aa18.08■□□□□ 0.48
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa18.05■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa18.05■□□□□ 0.48
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.04■□□□□ 0.48
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCB6Q9NP58 842 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNNC2P02585 160 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BFSP1Q12934 665 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLA2G12BQ9BX93 195 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AP1M1Q9BXS5 423 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KMT5AQ9NQR1 393 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA8SH3BPF8 625 aa18.04■□□□□ 0.48
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