RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439500.5

SPAM1-205, Transcript of sperm adhesion molecule 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPAM1, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPAM1-205	ENST00000439500	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	FAP	Q12884	760 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	AURKA	O14965	403 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	PPFIA3	O75145	1194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ZBED1	O96006	694 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	POU2F2	P09086	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	LTBR	P36941	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	KDM1A	O60341	852 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	GRK2	P25098	689 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CHKA	P35790	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ASPA	P45381	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	PRIM2	P49643	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	JAM2	P57087	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	BIRC3	Q13489	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ILDR2	Q71H61	639 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	KCT2	Q8NC54	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	WNT9A	O14904	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ALDH2	P05091	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	KRT15	P19012	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ALAS2	P22557	587 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	GSK3A	P49840	483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ST5	P78524	1137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500		Q96M66	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	AMY2A	P04746	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	NAT1	P18440	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	AMY2B	P19961	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	GPSM2	P81274	684 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	ELF2	Q15723	593 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPAM1-205	ENST00000439500	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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