RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 TCFL5Q9UL49 500 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 ATE1O95260 518 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRK-211ENST00000429595 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
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PTPRK-211ENST00000429595 PANK1Q8TE04 598 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRK-211ENST00000429595 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRK-211ENST00000429595 PI3P19957 117 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRK-211ENST00000429595 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.54□□□□□ -1.04
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PTPRK-211ENST00000429595 ATG4CQ96DT6 458 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-211ENST00000429595 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRK-211ENST00000429595 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
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PTPRK-211ENST00000429595 NFIXQ14938 502 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRK-211ENST00000429595 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRK-211ENST00000429595 PNLIPP16233 465 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRK-211ENST00000429595 ERVFRD-1P60508 538 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRK-211ENST00000429595 CLCQ05315 142 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 GPC2Q8N158 579 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 JDP2Q8WYK2 163 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 IRAK3Q9Y616 596 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-211ENST00000429595 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.5□□□□□ -1.05
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