RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 TMOD4Q9NZQ9 345 aa10.42□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 PTPRMP28827 1452 aa10.42□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 MAP3K19Q56UN5 1328 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 H0YGN5 161 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 PAEPP09466 180 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 KIF11P52732 1056 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 TFCP2Q12800 502 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 MAP7D1Q3KQU3 841 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 PIGWQ7Z7B1 504 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 NOSTRINQ8IVI9 506 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 TAF4BQ92750 862 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 AGXT2Q9BYV1 514 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 CABP5Q9NP86 173 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 TMCO1Q9UM00 188 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 NFS1Q9Y697 457 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 MYH13Q9UKX3 1938 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 A0A0G2JS52 829 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 TPBGLP0DKB5 382 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 PSMC4P43686 418 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 IGBP1P78318 339 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 SETDB1Q15047 1291 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 IRGCQ6NXR0 463 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 OTUD6AQ7L8S5 288 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 FAM133AQ8N9E0 248 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 SMC1BQ8NDV3 1235 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 GDAP1Q8TB36 358 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 MTMR8Q96EF0 704 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 FAM81BQ96LP2 452 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 FAM114A2Q9NRY5 505 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 ABLIM1O14639 778 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 KCNK3O14649 394 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 LSM1O15116 133 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 E2F6O75461 281 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 SKIP12755 728 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 FITM2Q8N6M3 262 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 DTX3LQ8TDB6 740 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGEF3Q9NR81 526 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 NMRK1Q9NWW6 199 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 NPATQ14207 1427 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 SH3TC1Q8TE82 1336 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC160A6NGH7 325 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 LGALS16A8MUM7 142 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 SNX3O60493 162 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 PEX11AO75192 247 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 PALMO75781 387 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 GNAZP19086 355 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 GNAT2P19087 354 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 PDE6CP51160 858 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 MAP7D3Q8IWC1 876 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC8CQ8TDW0 803 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 BRD8Q9H0E9 1235 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 111.5
TMOD1-203ENST00000395211 DENND2AQ9ULE3 1009 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 NAT1P18440 290 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 RPL13P26373 211 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 TARSP26639 723 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 SERPINB3P29508 390 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 ADCY1Q08828 1119 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 BNIP1Q12981 228 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 MTMR3Q13615 1198 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 SAPCD2Q86UD0 394 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 PBKQ96KB5 322 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 MTA3Q9BTC8 594 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 MMRN2Q9H8L6 949 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 KCNK9Q9NPC2 374 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 CYP39A1Q9NYL5 469 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF180Q9UJW8 692 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD1-203ENST00000395211 GOLGA8AA7E2F4 631 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-203ENST00000395211 GSTA2P09210 222 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-203ENST00000395211 ACADSP16219 412 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-203ENST00000395211 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-203ENST00000395211 SLC44A4Q53GD3 710 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-203ENST00000395211 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-203ENST00000395211 TRIM50Q86XT4 487 aa10.39□□□□□ -0.75
TMOD1-203ENST00000395211 LPIN2Q92539 896 aa10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms