RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 NAPAP54920 295 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 CHMP4BP1P59074 171 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 GPR20Q99678 358 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 ALG1Q9BT22 464 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 PBX4Q9BYU1 374 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 BAIAP3O94812 1187 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 LGALS2P05162 132 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 CDC27P30260 824 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 AP3B2Q13367 1082 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 BRF1Q92994 677 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 FAM161BQ96MY7 647 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 ZNF576Q9H609 170 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 COL6A3P12111 3177 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX3-201ENST00000370002 GNAT1P11488 350 aa23.27■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 ITGB5P18084 799 aa23.27■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.27■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 JADE2Q9NQC1 790 aa23.27■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 ESYT2A0FGR8 921 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 STXBP3O00186 592 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 CAND2O75155 1236 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 CKBP12277 381 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 ADCY7P51828 1080 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 MTMR1Q13613 665 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 UBE2SQ16763 222 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 SMCO2A6NFE2 343 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 CXCL10P02778 98 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 KCNA2P16389 499 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 APOBRQ0VD83 1088 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 RUFY3Q7L099 469 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 SERINC5Q86VE9 423 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 SLC9A7Q96T83 725 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 SCG2P13521 617 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 ZBBXA8MT70 800 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 EFCAB14O75071 495 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 CPA1P15085 419 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 EMSYQ7Z589 1322 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 SORBS3O60504 671 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 ATP9AO75110 1047 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 GNA11P29992 359 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 SREBF1P36956 1147 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 PBX2P40425 430 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 CEP55Q53EZ4 464 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 ANO3Q9BYT9 981 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 NRCAMQ92823 1304 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 IFNAR1P17181 557 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 GPNMBQ14956 572 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 GRIN2CQ14957 1233 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 NTRK3Q16288 839 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 C6orf50Q9HD87 102 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 NFASCO94856 1347 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-201ENST00000370002 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-201ENST00000370002 MEIS1O00470 390 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-201ENST00000370002 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PITX3-201ENST00000370002 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PITX3-201ENST00000370002 ADAM17P78536 824 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-201ENST00000370002 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PITX3-201ENST00000370002 BICD2Q8TD16 824 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-201ENST00000370002 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PITX3-201ENST00000370002 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-201ENST00000370002 KIF28PB7ZC32 967 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms