RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 IL17AQ16552 155 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 SPECC1Q5M775 1068 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 PPP4R3AQ6IN85 833 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 FBXO11Q86XK2 927 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 CEP57L1Q8IYX8 460 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 C3orf20Q8ND61 904 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 AFAP1L1Q8TED9 768 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 LPAR1Q92633 364 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 RABGGTAQ92696 567 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 GOLGA1Q92805 767 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF341Q9BYN7 854 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 FEM1BQ9UK73 627 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 SARM1Q6SZW1 724 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 KCND1Q9NSA2 647 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 PRR12Q9ULL5 1215 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1B0GUA9 196 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 OR52Z1P0C646 297 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 RHOXF2BP0C7M4 288 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 EPSTI1Q96J88 318 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 RHOXF2Q9BQY4 288 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 GSDMDP57764 484 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 CASP8Q14790 479 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 POSTNQ15063 836 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 AOPEPQ8N6M6 819 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 TRIML1Q8N9V2 468 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 FAM71BQ8TC56 605 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 DHX58Q96C10 678 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 DOCK1Q14185 1865 aa16.29■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 KCNB1Q14721 858 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 LETM2Q2VYF4 491 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 MOXD1Q6UVY6 613 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 USP49Q70CQ1 688 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 SPATA20Q8TB22 786 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 CCSER1Q9C0I3 900 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM260Q9NX78 707 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 SERTAD1Q9UHV2 236 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 FOSP01100 380 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 SARSP49591 514 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 USP11P51784 963 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 BRD3Q15059 726 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 POTEDQ86YR6 584 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM60Q9H2L4 133 aa16.28■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 PIK3CDO00329 1044 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 MTA1Q13330 715 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 MTMR9Q96QG7 549 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 WDR18Q9BV38 432 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 TRPM4Q8TD43 1214 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 BCAS4Q8TDM0 211 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 L1RE1Q9UN81 338 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXA3-201ENST00000317201 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 CDC25CP30307 473 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 PNOCQ13519 176 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 IFNKQ9P0W0 207 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 A0A087X0B3 334 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 MEIS2O14770 477 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 CYP3A7P24462 503 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 USP14P54578 494 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 CEP85LQ5SZL2 805 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 EDIL3O43854 480 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 MAP3K9P80192 1104 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 SCLT1Q96NL6 688 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 CUEDC2Q9H467 287 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM165Q9HC07 324 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 PNMA2Q9UL42 364 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF232Q9UNY5 417 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 MRFAP1Q9Y605 127 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 FNTAP49354 379 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 PDIA5Q14554 519 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXA3-201ENST00000317201 UBE2SQ16763 222 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms