RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBED6P86452 979 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 PIK3C2BO00750 1634 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP2R5EQ16537 467 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 NAA35Q5VZE5 725 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 CCNA1P78396 465 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 PDIA6Q15084 440 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT31Q15323 416 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 DCAF4Q8WV16 495 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 NDST4Q9H3R1 872 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 PIM2Q9P1W9 311 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF609O15014 1411 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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PTPRJ-208ENST00000615445 DPH5Q9H2P9 285 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 A6NNZ2 444 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 CAMTA2O94983 1202 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT15P19012 456 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 PIK3CAP42336 1068 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 MFAP3P55082 362 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 AP3B2Q13367 1082 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 DENND2CQ68D51 928 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 AGLP35573 1532 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.59■■□□□ 1.21
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PTPRJ-208ENST00000615445 USP17L10C9JJH3 530 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 CFAP157Q5JU67 520 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM206Q9H813 350 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB20Q9NX57 234 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 PARP2Q9UGN5 583 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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PTPRJ-208ENST00000615445 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 HESX1Q9UBX0 185 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 GRM4Q14833 912 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC63Q05C16 580 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 CASC4Q6P4E1 433 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRJ-208ENST00000615445 ORC4O43929 436 aa22.58■■□□□ 1.21
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PTPRJ-208ENST00000615445 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.58■■□□□ 1.21
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PTPRJ-208ENST00000615445 CCND2P30279 289 aa22.58■■□□□ 1.2
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PTPRJ-208ENST00000615445 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 GCNT4Q9P109 453 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP27A1Q02318 531 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 ARID5BQ14865 1188 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.57■■□□□ 1.2
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PTPRJ-208ENST00000615445 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.57■■□□□ 1.2
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PTPRJ-208ENST00000615445 ITIH3Q06033 890 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 NACA2Q9H009 215 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SP8Q8IXZ3 490 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SFI1A8K8P3 1242 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 HGSO14964 777 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC125Q86Z20 511 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF28PB7ZC32 967 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 F5H6K3 240 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 ADCY8P40145 1251 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-208ENST00000615445 KLRC3Q07444 240 aa22.56■■□□□ 1.2
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