RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 P2RX5Q93086 422 aa9.16□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM47Q96LD4 638 aa9.16□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 FAM20AQ96MK3 541 aa9.16□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 GINM1Q9NU53 330 aa9.16□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 FAM86B1E9PN63 330 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 N4BP3O15049 544 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 CCP110O43303 1012 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 TOMM70O94826 608 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 ADKP55263 362 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PRR16Q569H4 304 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 KRT26Q7Z3Y9 468 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 SULF1Q8IWU6 871 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 DDX12PQ92771 950 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 KIFC2Q96AC6 838 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 ABCB11O95342 1321 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PSMD2Q13200 908 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 CEP135Q66GS9 1140 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC174Q6PII3 467 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 DYMQ7RTS9 669 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PANX2Q96RD6 677 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 VPS16Q9H269 839 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 STK24Q9Y6E0 443 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.15□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa9.15□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MSH4O15457 936 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CFBP00751 764 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 POLR2MP0CAP2 368 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 RBL2Q08999 1139 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CENPPQ6IPU0 288 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CHADLQ6NUI6 762 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 LPAR1Q92633 364 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.14□□□□□ -0.95
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PDE4D-208ENST00000502484 POTEB3A0JP26 581 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 E9PMD0 336 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 DYNC1I1O14576 645 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MED24O75448 989 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 TUBB4AP04350 444 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM14Q14142 442 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 POTEBQ6S5H4 581 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D5Q92609 795 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 HPS3Q969F9 1004 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FEZ1Q99689 392 aa9.14□□□□□ -0.95
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PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 RLFQ13129 1914 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 LGALS16A8MUM7 142 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MFAP3LO75121 409 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 GYPCP04921 128 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 PLA2G4BP0C869 781 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 RPA1P27694 616 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 INPP5BP32019 993 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 STAT3P40763 770 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CNGA4Q8IV77 575 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SMC1BQ8NDV3 1235 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ERMNQ8TAM6 284 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC51Q96ER9 411 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 UIMC1Q96RL1 719 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 VAV3Q9UKW4 847 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PQC6 194 aa9.13□□□□□ -0.95
PDE4D-208ENST00000502484 ADM5C9JUS6 153 aa9.13□□□□□ -0.95
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