RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489918.1

C1orf61-220, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 427 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-220ENST00000489918 KPNA6O60684 536 aa22.56■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 STAM2O75886 525 aa22.56■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 SCG2P13521 617 aa22.56■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 ICAM3P32942 547 aa22.56■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 LAMC2Q13753 1193 aa22.56■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 PPTC7Q8NI37 304 aa22.56■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 KAT2BQ92831 832 aa22.56■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 PGBD1Q96JS3 809 aa22.56■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.56■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 SZT2Q5T011 3432 aa22.56■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 SMCO2A6NFE2 343 aa22.55■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.55■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.55■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 TIMP1P01033 207 aa22.55■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 TGFB3P10600 412 aa22.55■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 ADCY7P51828 1080 aa22.55■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 EPHB4P54760 987 aa22.55■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.55■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 GNPTABQ3T906 1256 aa22.55■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 SPATA33Q96N06 139 aa22.55■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 TMEM260Q9NX78 707 aa22.55■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 ADAMTS3O15072 1205 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 ZNF286BP0CG31 522 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 IFNAR1P17181 557 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 CHMP4BP1P59074 171 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 ANAPC15P60006 121 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 STK3Q13188 491 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 DGKDQ16760 1214 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.54■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 FIBPO43427 364 aa22.53■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 SLC34A2O95436 690 aa22.53■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 ITGB5P18084 799 aa22.53■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 SHHQ15465 462 aa22.53■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 LRCH3Q96II8 777 aa22.53■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.53■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.53■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 CYP2C18P33260 490 aa22.52■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 FPGSQ05932 587 aa22.52■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 MFSD5Q6N075 450 aa22.52■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.52■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.52■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 ANO3Q9BYT9 981 aa22.52■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.52■■□□□ 1.2
C1orf61-220ENST00000489918 CYP2C9P11712 490 aa22.51■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.51■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 NLRX1Q86UT6 975 aa22.51■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 IL17RAQ96F46 866 aa22.51■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 HIPK3Q9H422 1215 aa22.51■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 ATP9AO75110 1047 aa22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 F2P00734 622 aa22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 CSF2RAP15509 400 aa22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 PSEN2P49810 448 aa22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 NEDD9Q14511 834 aa22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 C8orf34Q49A92 452 aa22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 METTL7BQ6UX53 244 aa22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 GPRASP2Q96D09 838 aa22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 ALG1Q9BT22 464 aa22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.5■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 ESYT2A0FGR8 921 aa22.49■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 PPFIA4O75335 1185 aa22.49■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 AK2P54819 239 aa22.49■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 MFSD10Q14728 455 aa22.49■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.49■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.49■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.49■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.49■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.49■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.49■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.49■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 HAS3O00219 553 aa22.48■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 DTNBO60941 627 aa22.48■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 KCNA2P16389 499 aa22.48■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 CCL23P55773 120 aa22.48■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 SP4Q02446 784 aa22.48■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 SCRN1Q12765 414 aa22.48■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 AP3B2Q13367 1082 aa22.48■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 MTMR1Q13613 665 aa22.48■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.48■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.48■■□□□ 1.19
C1orf61-220ENST00000489918 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms