RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 TSPY8P0CW00 308 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 BUB1O43683 1085 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 KIF5BP33176 963 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 EXOC1Q9NV70 894 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 FUKQ8N0W3 1084 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 M0R2N6 131 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 STAT6P42226 847 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 ZBED6P86452 979 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 PAK2Q13177 524 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 IQCKQ8N0W5 287 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 CAVIN3Q969G5 261 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.86□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PQC6 194 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 GRM4Q14833 912 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 DGKHQ86XP1 1220 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 PSMA7O14818 248 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 ZNF263O14978 683 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 RASA1P20936 1047 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 RFC4P35249 363 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 TRAPPC10P48553 1259 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 MEA1Q16626 185 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 DNM1LO00429 736 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 ERCC3P19447 782 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 TMOD1P28289 359 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 GPSM2P81274 684 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 SGSM3Q96HU1 749 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 KRT12Q99456 494 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 PLAAQ9Y263 795 aa14.85□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 STXBP3O00186 592 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 OPLAHO14841 1288 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 GRAPQ13588 217 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 TRADDQ15628 312 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 VPS72Q15906 364 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 WLSQ5T9L3 541 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 NUP58Q9BVL2 599 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 DISC1Q9NRI5 854 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 GMNCA6NCL1 334 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 MAGEA1P43355 309 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 PLCB4Q15147 1175 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.84□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 CALML3P27482 149 aa14.83□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 BTDP43251 543 aa14.83□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 CRYMQ14894 314 aa14.83□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.83□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.83□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.83□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 SH2D4AQ9H788 454 aa14.83□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.83□□□□□ -0.03
NISCH-212ENST00000488380 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.83□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 MYZAPP0CAP1 466 aa14.83□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 SRGNP10124 158 aa14.83□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 RASSF7Q02833 373 aa14.83□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 MSL1Q68DK7 614 aa14.83□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.83□□□□□ -0.04
NISCH-212ENST00000488380 ADSSL1Q8N142 457 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms