RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 USP6NLQ92738 828 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 CDHR1Q96JP9 859 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 MBOAT7Q96N66 472 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 C11orf49Q9H6J7 331 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 COL20A1Q9P218 1284 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTS3O15072 1205 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 ZNF76P36508 570 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PRPHP41219 470 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 LETM2Q2VYF4 491 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 GNPTABQ3T906 1256 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 CEP55Q53EZ4 464 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 ANO1Q5XXA6 986 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 KCNV1Q6PIU1 500 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 NLRX1Q86UT6 975 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 KCNG4Q8TDN1 519 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 APBA2Q99767 749 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 SOWAHBA6NEL2 793 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA6L22H0YM25 854 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 BAG4O95429 457 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 TGFB3P10600 412 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 CNTN2Q02246 1040 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PDE4DQ08499 809 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 SLC39A14Q15043 492 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 OLFML2BQ68BL8 750 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 SLFN12Q8IYM2 578 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 GPRASP2Q96D09 838 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 FAM20AQ96MK3 541 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 MXRA8Q9BRK3 442 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 NRBP1Q9UHY1 535 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 RCOR1Q9UKL0 485 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 GJD2Q9UKL4 321 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 ELP1O95163 1332 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 MEIS1O00470 390 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 NEMFO60524 1076 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 COBLO75128 1261 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PPP6R2O75170 966 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PGK2P07205 417 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 CYP2B6P20813 491 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PTMSP20962 102 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 TRIB2Q92519 343 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 FERMT2Q96AC1 680 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 MAML3Q96JK9 1138 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PGBD1Q96JS3 809 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 USP28Q96RU2 1077 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 JADE2Q9NQC1 790 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 FAM205CA6NFA0 338 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 FIBPO43427 364 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 NCLP19338 710 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 ICAM3P32942 547 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 MCM7P33993 719 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 STK38Q15208 465 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 TMEM87AQ8NBN3 555 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 SPATA32Q96LK8 384 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 RAB34Q9BZG1 259 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 VTA1Q9NP79 307 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 STK24Q9Y6E0 443 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PLXNB2O15031 1838 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 SPTLC2O15270 562 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 EDIL3O43854 480 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 ATP2B1P20020 1258 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PTGDRQ13258 359 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 MTMR1Q13613 665 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PTPAQ15257 358 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 ZNF174Q15697 407 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 CALCRLQ16602 461 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 FAM173BQ6P4H8 233 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G4DQ86XP0 818 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 FGD4Q96M96 766 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 GUCD1Q96NT3 240 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 RIT2Q99578 217 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-211ENST00000488243 SENP7Q9BQF6 1050 aa13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.7 ms