RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 IRF2BP1Q8IU81 584 aa19.99■□□□□ 0.79
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ACTB-201ENST00000331789 POTEIP0CG38 1075 aa19.98■□□□□ 0.79
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ACTB-201ENST00000331789 TC2NQ8N9U0 490 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP19.94■□□□□ 0.789e-78■■□□□ 11.7
ACTB-201ENST00000331789 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 EEF2KMTQ96G04 330 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 TRERF1Q96PN7 1200 aa19.94■□□□□ 0.78
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