RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UNC13DQ70J99 1090 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC5A5Q92911 643 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL20A1Q9P218 1284 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPA1P27694 616 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STX17P56962 302 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NELFBQ8WX92 580 aa24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP2A1O14983 1001 aa24.46■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPHX2P34913 555 aa24.46■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSDMDP57764 484 aa24.46■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE4DQ08499 809 aa24.46■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRKG1Q13976 671 aa24.46■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NIPA1Q7RTP0 329 aa24.46■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.46■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSADQ9Y600 493 aa24.46■■□□□ 1.51
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POTEB3A0JP26 581 aa24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POTECB2RU33 542 aa24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MED24O75448 989 aa24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMD10O75832 226 aa24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCRP11274 1271 aa24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP2R5CQ13362 524 aa24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POTEBQ6S5H4 581 aa24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WNK4Q96J92 1243 aa24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UIMC1Q96RL1 719 aa24.45■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMA7O14818 248 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DLK2Q6UY11 383 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CATSPER3Q86XQ3 398 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAF1Q9H063 256 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLTPD2A6NH11 291 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBXN2AP68543 259 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX12PQ92771 950 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INTS13Q9NVM9 706 aa24.44■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.43■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EHHADHQ08426 723 aa24.43■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRCH2Q5VUJ6 765 aa24.43■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.43■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.43■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLA2G4BP0C869 781 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NF2P35240 595 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STK4Q13043 487 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMC6Q7Z403 805 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VSTM4Q8IW00 320 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC8AQ8IWT6 810 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDCA5Q96FF9 252 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF146Q9NTX7 359 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1B0GTH6 734 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 E9PMD0 336 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPAG1Q07617 926 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMD2Q13200 908 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TKFCQ3LXA3 575 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIT2Q99578 217 aa24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POTEFA5A3E0 1075 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POTEIP0CG38 1075 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGB5P18084 799 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POTEGQ6S5H5 508 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA0895Q8NCT3 520 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA1524Q8TCG1 905 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIPK3Q9Y572 518 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.41■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EML1O00423 815 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRIN3BO60391 1043 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GAS7O60861 476 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARP10275 920 aa24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms