RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233190.10

NDUFS1-201, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDUFS1, Length 11,819 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-201ENST00000233190 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 TADA2AO75478 443 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 RANBP1P43487 201 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 TNFAIP2Q03169 654 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 ASIC2Q16515 512 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 MFN1Q8IWA4 741 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 VSTM5A8MXK1 200 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 TP53BP2Q13625 1128 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 ARHGEF7Q14155 803 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 SKIP12755 728 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 HOXC12P31275 282 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 SLC12A1Q13621 1099 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 PTPROQ16827 1216 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 IZUMO3Q5VZ72 239 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 TPH2Q8IWU9 490 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 HES6Q96HZ4 224 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 FSD1LQ9BXM9 530 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 DDHD2O94830 711 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 CCDC130P13994 396 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 HPCAP84074 193 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 RASGRF2O14827 1237 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 TEX9Q8N6V9 391 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 MMP19Q99542 508 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 HAND2P61296 217 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.44□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 PDCLQ13371 301 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 FANCEQ9HB96 536 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 SLAIN2Q9P270 581 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 SCOCQ9UIL1 159 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 ERICH4A6NGS2 130 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 GOLGA8TH3BQL2 631 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 HUS1O60921 280 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 BMP10O95393 424 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 GOLGA8HP0CJ92 632 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 ATP1A2P50993 1020 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 C21orf59P57076 290 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 CENPCQ03188 943 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 PLD1Q13393 1074 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 FAR1Q8WVX9 515 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 GRM8O00222 908 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 Q9H521 79 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 TRIP10Q15642 601 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 ERO1AQ96HE7 468 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 USP17L3A6NCW0 530 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 USP17L4A6NCW7 530 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 AAK1Q2M2I8 961 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 GPR158Q5T848 1215 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 KRT80Q6KB66 452 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 ZBTB18Q99592 522 aa7.43□□□□□ -1.22
NDUFS1-201ENST00000233190 TRIM15Q9C019 465 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms